(二)60萬倉庫月稅8萬五，重復納稅比例近50%
利潤才12元，但是繳稅額卻高達39元。當然有時候公司經營得不好，稅收比盈利高，這并不是什么奇怪的事情，但讓這位企業負責人覺得不合理的是，在39元稅款中，有5元錢是屬于重復計稅，原因僅僅是貨物在運輸中換了承運人，由于有發票往來，即使是分公司的關系也需要再次為同一單貨物繳稅。快遞環節如此，那么倉儲環節又是怎樣呢？
黎建明一直為重復征稅的問題感到撓頭，他花24萬租來這個倉庫，又以 60萬的價錢包租出去，因為中間出現了重復計稅，他一個月需要交稅8萬5千元，其中4萬元屬于重復交稅。黎建明說，他的月純利潤是24000，僅重復繳納的稅款就是他利潤的1.33倍。
廣州中聯環宇現代物流有限公司財務總監林劍芳說道：“我們租業主的倉庫交的24萬里面，已經交的稅金包括有營業稅、城建稅、教育費附加，還有房產稅、土地使用稅，這里加起來已經納的稅是4.5萬。”
林劍芳解釋說，重復納稅出現在第二次轉包的過程中，24萬租來的倉儲外租出去可以有60萬的營業額，刨去成本，他的實際收入是36萬，但是因為分包要重復計稅，他實際交稅是按照60萬來交的，因此一個說交了有8.5萬的稅費。
納稅8萬五，重復納稅部分高達4萬。遭遇重復納稅的倉儲，中聯環宇物流公司在廣州就有四個，總面積6萬多平米，負責人黎建新給記者算了一筆總賬。廣州中聯環宇現代物流有限公司執行董事黎建新說：“我們租回來是700萬，我們轉租出去是1600萬，中間是有900萬的一個毛利在里面，可是我們企業實際的利潤120萬，在我們120萬的里面有重復交稅多的時候到50萬。”
針對于倉儲的稅費為何在重復征收后達到這么高，廣州物流協會秘書長張強在研究中發現高稅率推高了倉儲企業的稅費。從企業所得稅稅率來講，雖然分了三個等級，但倉儲企業多屬第三個等級，從2008年1月1日起，企業所得稅按 25%的最高稅率繳稅。此外，現行營業稅的稅目將物流業務劃分為運輸與服務兩大類：運輸類，其中裝卸、搬運執行運輸業的營業稅，稅率是3%，倉儲、配送、代理等執行的是服務業的營業稅，稅率是5%。不同環節的營業稅率不一致，給企業經營帶來了麻煩，也容易出現重復征稅。因此，廣州物流協會秘書長
張強表示：“哪些占了是倉儲費用，哪些是運輸費用是很難說清楚的，因為物流是個組織活動，倉儲和運輸有效組織起來的一種經營活動，我們建議就統一成一種稅率。”
賀登才是中國物流與采購聯合會副會長，早在2009年，他就和相關專家在《中國物流業稅收管理研究》的調查報告中建議：統一物流業各環節業務營業稅適用稅率，倉儲等業務參照現行運輸業3%稅率征收。而在倉儲業不合理的重復征稅問題上，他認為主要納稅點在土地使用稅上。
中國物流與采購聯合會，中國物流學會副會長賀登才說：“07年1月份開始，平均土地使用稅增長兩倍，但有的地方根據地方的情況掌握，我們了解到的有的漲到9倍、15倍。”所以，賀登才建議，針對物流服務的社會公益性特點，應該與傳統房地產業和一般意義上的租賃服務業進行區分，降低現代物流企業土地使用稅稅率，建議按各地規定的30%征收，或者以2005年稅率為基數，一定五年不變，以維持重資產型物流企業的正常經營。
中國物流與采購聯合會，中國物流學會副會長賀登才說：“盈利性好的企業，總的最后收入有一半或者一多半是要用來納稅的，如果說是這個企業經營狀況不太好的話，也就是出現虧損的，虧損的你也是照樣要交稅的，因為營業稅是你只要有營業，你就要交稅。”
劉隆亨是中國財稅法學研究會會長，北京大學稅法研究中心主任，長期從事財稅法的政策研究工作。他告訴記者，一個物流公司需要準備十幾種發票，物流業需要交納的稅種即多且亂，他認為核心在于物流行業至今沒一個精準的性質定位。
中國財稅法學研究會會長，北京大學稅法研究中心主任劉隆亨說：“還有更重要的物流行業定性沒有解決，要解決它的性質，他是個什么性質，是個什么定位，根據它的定位，根據它的性質我們確定它應該是什么樣的稅收。”